2011年1月20日 星期四

65. Kary Mullis,發明了五十年來最實用的革命性技術--PCR




[簡介: Michael SmithH. Gobind Khorana]


Kary Banks Mullis (1944- )發明polymerase chain reaction (PCR聚合酶鍊反應1983),和Michael Smith (1932-2000)[註一]共同獲得1993Nobel Prize



生於Lenoir (美國North Carolina),在Georgia Institute of Technology 以及加州大學Berkeley,於1973年取得PhD。之後曾經在UC Berkley教過書、寫過小說,再進入Kansas大學做生化研究,又開過麵包店兩年,後來他的朋友Thomas White相勸,於1979年進入加州的Cetus Corporation of Emeryville


在此公司,他設計出polymerase chain reaction ,可以將一個DNA在短時間內複製成無數個DNA,因而獲得諾貝爾化學獎。



PCR的原理有三個步驟: 一、將DNA加高熱,使DNA中成對的雙螺璇(double helix) denature,分裂成單鍊;二、冷卻,讓單鍊的primers “退溫”(anneal);三、然後以促進DNA合成的酵素DNA polymerase,在高熱中,使各個單鍊再從溶液中徵招需要的”(base),形成兩對新的雙螺璇double helix (extension)。這一輪的反應持續地重複,DNA會複製,成為四個、八個、十六個、、、,幾何級數地增加。數小時內就可以有數十億的DNA被複製。



用這個方法,任何樣品中只要有一隻細菌或一個細胞的DNA,不論是活的或是死的,都可以大量複製,到可以檢驗DNA序列(sequence),認出是甚麼微生物,或是誰的DNA。因此PCR可用於診斷出細菌或病毒等感染病原、檢查遺傳性疾病、法醫學偵查罪犯、檢查親屬關係、研究人類演化等等,其用處無數,對現代生活各方面有革命性的影響。[:診斷感染症,檢查出病原是非常地重要,確認病原就可以對菌下藥。因此懷疑有感染的病人,都要做身體各種體液的細菌培養,包括血液、痰、尿、傷口、膿,甚至有必要的話,胸腔液、腦脊髓液、腹膜液、糞便等等。有細菌,就可以做藥敏試驗,選用適當的抗生素。不過一般感染症病患,能夠培養出細菌的不到一半,而被培養出來的細菌也不一定就是病原。培養出來的細菌很可能就是病原的,只約三分之一;如果已經開始抗生素治療時,血液中就算是有細菌,培養出細菌的機率很低 (對大部分感染病患,要如何選用適當的抗生素,是要靠仔細的病史詢問、以及醫師的學識及經驗)。腦脊髓液、胸腔液、腹膜液內的結核菌數目少,用培養的方法很難做診斷;這時候PCR的用處極大。不過PCR的費用目前還很貴,不能例行地使用。PCR認出來的細菌,也無法做藥敏試驗。]



但是這個發明是否Mullis一人的功勞,卻有一番爭議。他的自傳裡說,在1983年和他的女朋友開車到他週末休息處,途中他突然想到這個方法。其實PCR的原理在1971年有一位挪威學者Kjell Kleppe1968年的Nobel Laureate H. Gobind Khorana [註二]合寫一篇二十頁長的論文,刊登在Journal of Molecular Biology。且早在1969年六月十八日,Kleppe就在New HampshireGordon Conference演講,並使用兩個primersDNA polymerase示範DNArepair replication,將一個DNA片段複製成為四個。當時在場聽講的有Stuart Linn教授,Linn回去自己的課堂後,用Kleppe的材料重複實驗給學生看,這學生當中就有Kary Mullis! (可能Mullis吸收了這個觀念,埋入腦筋潛意識內,幾年後這個想法再出現在他腦筋中,以為全部是他自己想出來的。這是常有的現象,也不能說是欺騙或誤導)


這個PCR的困難處,是在需要選用耐熱的DNA polymerase。原來使用E. colipolymerase (酵素,是蛋白質,一般蛋白質在加熱時會被破壞)促進DNA雙螺旋(double helix)分裂成單鍊或聚合時,需要加熱,加熱時這個酵素蛋白會很快被破壞,因此每一個cycle都要加新的DNA polymerase進去,費時費工。1986Mullis想到使用耐熱的Taq polymerase就不必要每個cycle填加一次酵素,他再使用輪迴 "加熱-冷卻" 的機器,thermal cycling有此進展,PCR才得以成為可以自動化、實用的快速檢驗法。


Taq polymeraseThomas Brock1965年從靠近火山口高熱溫泉中生長的細菌Thermus aquaticus分離出來的,簡稱Taq PolTaq。它能在75-80°C保存其活性,在97.5°C 時有九分鐘的半生期;而可將DNA1000base pair72°C中不需要十秒鐘就能複製。


Taq的一個缺點就是複製時會發生錯誤,每九千個nucleotides就有一個錯。現在的DNA polymerase是使用從一種單細胞生物、不靠太陽的光和熱、在沸點溫度可以生存、沒有細胞核或細胞內小器官的 "第三類生物" (archaeon) Pyrococcus furiosus分離出來的Pfu DNA polymerase,用這個酵素就幾乎沒有複製的錯誤(high fidelity amplification)。這細菌在70 °C (158 °F) 103 °C (217 °F)間的溫度都可以生長,最適當的生長溫度是100 °C (212 °F)pH則是5 9 (optimum pH 7)


不過,是否Mullis自己想出Taq也有Cetus公司的人提出異議。有一本書寫道,1983Mullis提出PCR的想法時,他的同事們都無法了解其重要性,似乎只有Mullis "先知"。但1983Mullis提出PCR的觀念,Cetus就讓Mullis專門做這方面的工作。Cetus也讓Randall SaikiHenry Erlich加入PCR計畫,設法做出HIV及其他利用PCR的工作。Saiki在數月之內寫出第一篇報告,而Mullis還在寫他的描寫PCR的文章,顯然公司反應很快。


考古學家Paul Rabinow對「科學的發現」有興趣,於1966年出書寫PCR方法的歷史,質疑Mullis是否發明了這個方法。他不認為科學的發現是一個人、一個天才的產品。他寫,PCR的發展就是典型的團隊的工作(teamwork)! [http://www.worldlingo.com/ma/enwiki/en/Kary_Mullis] [: 一個新的構想,idea,其實很多是其他人的想法,一滴一點,經歷多年累積成型的]


1986年他離開Cetus,成為San DiegoXytronyx, Inc.的分子生物學主任。1987開始當多家公司的顧問。(AngenicsCytometricsEastman KodakAbbott Labs)


PCR的研發後Cetus1991年將其專利權賣給Hoffman-La Roche,價格是三億美元!!  Mullis研發PCR之後得到的獎金只有一萬美元!。後來DuPont公司要和Roche競爭買下專利失敗,提起訴訟,說Khorana1971年就有此構想,Cetus並不能聲稱擁有專利。Mullis雖已離開Cetus但替它辯護(其實也是替自己辯護)Khorana則不願出庭作證,因此1991DuPont敗訴。




除了PCRMullis還發明了照射紫外線就會變色的塑膠;發明從血液中十五分鐘之內透析出DNA的方法(本來需要一整天)1992年他建立一個公司,想要賣附有名人(Elvis PresleyMarilyn Monroe等人)DNA之裝飾品! 1994年,他在California Monthly也承認製造過、使用過很多種迷幻藥,amphetamineLSD等,說當時加州的人很多都在用,是mind-opening experience,幫助他想出PCR的方法!


在得到諾貝爾獎之後,他開始講一些不是他專業份內的意見: 不認為AIDS是由HIV引起;不認為太空中ozone layer(臭氧層)減少,地球氣溫逐漸增高;又說他相信占星術、心靈感應等。都是反科學的怪想法,而受到很多批評。


他結婚三次,有兩個前妻生的孩子。喜歡surfing (衝浪)


[註一: Michael Smith1932-2000,英國裔加拿大生化學家。從1961年開始在Univ. of British Columbia研究,到去世。研究DNA,研發一種方法 (site-directed mutagenesis),可以重組基因碼,可以將蛋白質內的特定氨基酸置換。他的研究可以導致癌細胞抗體的研發,以及改造出生長快速的穀物。因此他和Kary Mullis共享1993年諾貝爾化學獎]


[註二: H. Gobind Khorana1922- Har Gobind Khorana,或 Hargobind Khorana,印度裔美國生化學家,研究核酸內的nucleotide如何控制蛋白質的合成,而和Marshall W. NirenbergRobert W. Holley共同獲得1968Nobel Prize。同年他歸化成美國公民]


 


4 則留言:

  1. 感謝提供這些資料、讓我更了解當時被認為是「hippie」一族的Mullis的生涯。
    現在對得到1997年諾貝爾獎的「狂牛病」的變性prion蛋白質感染原理的stanley Prusiner也有人說是「抄」襲1967年英國學者Grifice的理論比1982年Prusiner發表時早15年。

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  2. 謝謝回應! 有回應,就會再讀一下,才曉得還要修繕文句。
    我現在寫的是第六章,抗微生物藥劑的發展。介紹不少和主題無關的學者。
    狂牛症是第七章了,希望能看到你說的這些人。

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  3. 現在身體情況好嗎?休息很重要!
    ご大作を楽しみにお待ち致しております。

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  4. Paresthesiaが少々ひどくなっています。体の具合はそれほど良くありませんが、毎日出来るだけ仕事はしております。ご期待に損ねないよう努力いたします。
    John Tyndallは物理学者ですが、黴の研究ォした事が有るので、彼氏の伝奇もいれました。この本のお陰で、僕も勉強になりましたよ。
    息子夫婦が居ないので、今週孫たちの世話ォしております。毎朝六時に起きなければならないので、まあ、若返りしたつぃもりで。孫の面倒は辛いやら、楽しいやら。
     
     
     
     

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